Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LGSNQ5TDP6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms