Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms