Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms