Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALFQ53S48 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms