Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms