Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms