Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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