Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms