Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms