Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MICAQ29983 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MICAQ29983 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MICAQ29983 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MICAQ29983 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MICAQ29983 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MICAQ29983 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MICAQ29983 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms