Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms