Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDR2Q16832 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDR2Q16832 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDR2Q16832 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDR2Q16832 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDR2Q16832 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR2Q16832 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms