Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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