Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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