Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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GRIK5Q16478 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK5Q16478 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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