Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms