Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms