Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NWD1Q149M9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NWD1Q149M9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
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