Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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NFIXQ14938 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NFIXQ14938 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFIXQ14938 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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