Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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