Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DNASE1L3Q13609 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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DNASE1L3Q13609 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms