Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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