Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RLFQ13129 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
RLFQ13129 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RLFQ13129 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RLFQ13129 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms