Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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