Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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