Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMAN2Q12907 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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