Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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