Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms