Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FMODQ06828 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FMODQ06828 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms