Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX1Q04741 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms