Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F1Q03052 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms