Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSF1Q00613 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms