Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms