Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIM1P81133 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIM1P81133 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIM1P81133 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIM1P81133 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms