Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms