Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms