Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms