Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ACTBP60709 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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