Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms