Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB28P51157 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms