Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms