Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX2P50458 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LHX2P50458 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LHX2P50458 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms