Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms