Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms