Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms