Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms