Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms