Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP6P35125 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP6P35125 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP6P35125 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP6P35125 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms