Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms