Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms